Öncelikle xorg.conf dosyasında saydamlık ayarlarını etkinleştirmek gerekiyor. xorg.conf dosyası /etc/X11/xorg.conf (en azından xubuntu'da burada, pardus'ta da oradadır büyük olasılıkla) yolunda bulunuyor. Bu dosyayı açıp içerisine/en alt satırına

Section "Extensions"
    Option "Composite" "Enable"
EndSection

satırlarını koplayamak gerekli.

konsole'u açıp sudo nano /etc/X11/xorg.conf komutunu vererek bu dosyayı açabilirsiniz.

Sonrasında xfce Ayarlar Yöneticisi açılıp Pencere Yöneticisi İnce Ayarları bölümüne gidilir. Birleştirici sekmesinde yer alan Görüntü Düzenlemeyi Etkinleştir seçeneği etkinleştirilmeli.

Sonrasında Panel bölümüne gidilip Paneli opak yap seçeneği kaldırıldığında paneller şeffaf/saydam olacaktır. Birden fazla panel varsa, açılır listeden ilgili panel seçilip Paneli opak yap seçeneği ilgili panel için de etkisizleştirilmelidir, yoksa ilk panel şeffaf/saydam olsa bile diğer paneller opak kalmaya devam edecektir.

kaynak:
http://forum.xfce.org/index.php?topic=3398.0